Game sẽ diễn ra sau các sự kiện của Xenoblade Chronicles và Xenoblade Chronicles 2 . Trong phần thứ ba này, bạn đóng vai nhân vật mới là Noah và Mio, những người dẫn đầu một đội thám hiểm từ hai quốc gia đối địch Agnus và Keves trong một cuộc chiến không có hồi kết. Nói tới đây bạn nghĩ hai quốc gia chiến đấu vì tài nguyên? lương thực? Nhưng không họ chiến đấu vì sự tồn tại của mình theo đúng nghĩa đen. Cứ mỗi mạng sống những người lính trên chiến trường đoạt được thì chiếc đồng hồ sự sống bên phe họ sẽ đầy lên một bật giúp duy trì sự tồn tại cho cả đất nước. Nhưng nếu bạn nghĩ họ chỉ cần giết đủ nhiều là có được cuộc sống bất tử thì bạn đã nhầm tập hai. Mỗi người lính của hai phe chỉ có 10 năm để sống. Sau khi tồn tại đủ 10 năm họ sẽ về gặp người lãnh đạo phe mình để ròi được tiễn đưa đi theo hình thức đặc biệt. Chúng ta sẽ theo chân Noah một con cừu đen của vương quốc Keves, anh sẽ cùng đồng đội của mình ở cả hai phe tìm cách phá hủy vòng lập vô tận này để giải cứu tất cả mọi người trên thế giới....
Phần cốt truyện của Xenoblade Chronicles 3 đã tuyệt vời rồi nhưng gameplay lại còn tốt hơn nữa vì hệ thống chiến đấu trong game vô cùng rộng lớn và có chiều sâu, Xenoblade Chronicles 3 gần như gom mọi yếu tố mà thể loại RPG có thể có gộp vô trong một như hệ thống lớp nhân vật, ngọc, các chiêu thức kết hợp,….